Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds1P98191 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds1P98191 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds1P98191 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms