Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Shc1P98083 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shc1P98083 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms