Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx2P97474 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms