Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SmsP97355 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SmsP97355 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SmsP97355 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SmsP97355 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SmsP97355 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SmsP97355 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SmsP97355 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms