Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps3aP97351 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps3aP97351 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms