Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkp1P97350 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkp1P97350 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms