Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mesp1P97309 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mesp1P97309 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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