Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElocP83940 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElocP83940 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ElocP83940 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ElocP83940 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ElocP83940 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ElocP83940 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElocP83940 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ElocP83940 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ElocP83940 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ElocP83940 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms