Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx1P81068 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx1P81068 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx1P81068 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms