Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms