Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx4P70452 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx4P70452 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx4P70452 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx4P70452 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx4P70452 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx4P70452 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx4P70452 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx4P70452 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx4P70452 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms