Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa1P70365 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa1P70365 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms