Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufd1P70362 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ufd1P70362 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ufd1P70362 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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