Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp3P70281 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp3P70281 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms