Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrig1P70193 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig1P70193 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms