Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SbdsP70122 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms