Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkcbP68404 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcbP68404 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms