Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms