Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tra2bP62996 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tra2bP62996 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms