Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd2P62317 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms