Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm3P62311 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm3P62311 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms