Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rps29P62274 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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