Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps18P62270 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps18P62270 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms