Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg6P61406 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg6P61406 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms