Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arf3P61205 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms