Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2nP61089 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2nP61089 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2nP61089 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2nP61089 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2nP61089 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms