Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms