Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Paxbp1P58501 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Paxbp1P58501 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms