Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ctdsp1P58466 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdsp1P58466 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdsp1P58466 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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