Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms