Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms