Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CdaP56389 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CdaP56389 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CdaP56389 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CdaP56389 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CdaP56389 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CdaP56389 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CdaP56389 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CdaP56389 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms