Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acod1P54987 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acod1P54987 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms