Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrlP54846 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrlP54846 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrlP54846 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrlP54846 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrlP54846 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrlP54846 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms