Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PitpnbP53811 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms