Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PctpP53808 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PctpP53808 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PctpP53808 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms