Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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