Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Map3k1P53349 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Map3k1P53349 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Map3k1P53349 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms