Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efnb1P52795 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efnb1P52795 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms