Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ClgnP52194 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ClgnP52194 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms