Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr5P51682 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms