Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccr4P51680 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms