Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt6aP50446 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt6aP50446 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms