Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc13P50207 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms