Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtpreP49446 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtpreP49446 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms