Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbr1P48758 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbr1P48758 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms