Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CratP47934 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CratP47934 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CratP47934 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CratP47934 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CratP47934 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CratP47934 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CratP47934 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CratP47934 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CratP47934 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms