Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Myo1bP46735 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1bP46735 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms