Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdkn1bP46414 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms