Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgavP43406 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms